Le terme agoniste désigne un muscle dont l'action permet de produire le mouvement (l'action principale dans un mouvement donné) que l'on désire obtenir. Le terme antagoniste désigne l'inverse.
Ce terme désigne également une substance avec laquelle on réussit à produire l'effet recherché, ou qui accroît un effet. Ceci se produit au niveau des récepteurs des cellules qui constituent les tissus. Cette substance est naturelle, fabriquée par le corps humain, soit médicamenteuse.
Les agonistes de la morphine entre autres, sont des substances chimiques prescrites car elles possèdent des propriétés analgésiques (antidouleurs).
Il existe des médicaments du système nerveux végétatif (autonome, «automatique») qui sont des agonistes de l'adrénaline. Il s'agit des alphastimulants, des bêtastimulants. D'autres médicaments du système nerveux végétatif sont des agonistes de l'acétylcholine (cholinergique).