La myélite, de façon générale, ne doit pas être confondue avec les affections neurologiques suivantes (liste non exhaustive) :
- Compression médullaire.
- Hématomyélite : généralement, des notions de traumatisme sont retrouvées.
- Occlusion de l'artère spinale antérieure.
- Occlusion de l'aorte abdominale (dans ce cas, les pulsations fémorales sont absentes).
- Polynévrite.