Les germes en causes sont (liste non exhaustive) en ce qui concerne les bactéries:
- Le staphylocoque
- Streptocoques
- Le pneumocoque
En ce qui concerne les virus :
- Herpès
- Myxovirus (virus de la rougeole)
- Virus de la varicelle
En ce qui concerne les parasites (variété de conjonctive très rare en Europe) :
Les autres types de conjonctivite sont quelquefois dues à une allergie, un eczéma des paupières, une irritation par une substance chimique ou cosmétique, un collyre, une lentille de contact, poussière, une atmosphère tabagique, etc.